平凡的小学三年生高町奈叶，发现从异世界米得基鲁达来的尤诺·斯克莱亚受伤而倒下。他来到这个世界的理由。那因为是他挖掘到太古遗产(平行次元中存在的高度科技的文明的遗产)“宝石之源”分散到“这个世界”。知道了这个情况的高町奈叶，成为与尤诺一起收集宝石之源然后封印的魔法少女.最终在时空管理局... 全部专辑信息>>

简介：平凡的小学三年生高町奈叶，发现从异世界米得基鲁达来的尤诺·斯克莱亚受伤而倒下。他来到这个世界的理由。那因为是他挖掘到太古遗产(平行次元中存在的高度科技的文明的遗产)“宝石之源”分散到“这个世界”。知道了这个情况的高町奈叶，成为与尤诺一起收集宝石之源然后封印的魔法少女.最终在时空管理局里工作.战斗结束后，半年过去了，奈叶一边在宁静的生活中继续练习着魔法，一边期盼着和朋友们的再会。突然有一天，她遭到了神秘人物的袭击，在随后出现的菲特的帮助下，两人终于击退了敌人，可是奈叶的魔力却被夺走了。原来这是一群阴谋计划完成禁断的魔导书“暗之书”的人在四处收集魔力。两人随后结识了掌握宿命之匙的少女八神疾风，三个少女一同勇敢面对命运的争斗……
舞台为前作10年后，在航空机场陷入火海之际，少女スバル·ナカジマ被时空管理局的魔导师所救。4年后，她成为了管理局的陆战魔导师，并崇拜着自己的救命恩人，时空管理局武装队·航空战技教导队所属战技教导官，空之魔导师中的超S级人物，高町奈叶一等空尉
英国克里斯蒂拉是一所著名的声乐学校，但是于一天早晨的9：40分，该学校收到了来自同一地区的第十三封恐怖信，而内容则是与前12封大同小异，均是从杂志，报纸上剪下来，然后用单词拼成的，内容是：“我们正在寻找提奥烈 .克里斯蒂拉的最后遗产的所在地，我们需要那把钥匙，我方已经准备好了相应的补偿，请求联络，如果不回应要求的话，我方不得不改变对待方式，请尽快答复。”而对于该遗产的整理早已结束，虽然还有一些零碎的，但是对于他们能够寄出恐吓信的遗产更本就等于没有，虽然校方以通过多种途径表达了这个意思，但是对方却回答“如果不接受这最后通告的话，在你的身边将会发生不好的事情。”而这句话的确应验了，学校的校长菲亚瑟身边对次发生了恐怖事件。而同时作为风靡全球的歌手的她，为了确保学校的巡回音乐会的安全，请来了她多年前的朋友，也就是现在从事保镖行业的艾莉丝，来保证其演出安全的进行而作为菲亚瑟的贴身保镖。而巡回的第一站是日本........对于注重顾主安全的保镖，艾莉丝则建议尽量减少演出的次数，但是菲亚瑟拒绝了,因为日本有一位菲亚瑟信任的人在，他们也是艾莉丝见过多次的黑法姐弟......
　　同一时刻，在香港的一栋偏僻的住宅里，潜入了多名飞虎队队员，虽然他们拿着先进的武器，但却被两个手持小太刀的青年打得全军覆没，并且司令被俘.....而这两人就是高町 美由希（小太刀二刀御神流剑士）和高町 恭也（小太刀二刀御神流师范御神不破流），而这一次战斗只是为了二人的修炼.......